1952年设立道立忠南大学，1957年设置大学院。1962年与忠北学院合并改编为国立忠清大学，1963年分离为原来的国立忠南大学。2002年开设了综合信访中心、形质转换复制猪研究中心、和平安保大学院。校训为创意、开发、服务。
到2001年为止由6个研究生院（一般研究生院、经营研究生院、教育研究生院、行政研究生院、保健研究生院、产业研究生院、特许法务研究生院、和平安保研究生院）、12个单科学院、20个学部（系）、两个学科群、55个学科、37个专业构成。
附属机关有图书馆、博物馆、情报通信院、共同实验实习馆、毫微米新素材工学研究所、外国语教育院等，附属研究机关有地域开发研究所、体育科学研究所、动物医学研究所、百济研究所、工业教育研究所、医药品开发研究所、环境问题研究所、教育发展研究所、北美洲研究所等41个所。